中村在绫波丽的病房内里对着身旁的绫波丽抱怨道：“真不明白为什么碇司令还要招募新的适格者，明明只要有我出击就好了。”
绫波丽冷冷地回应：“不知道……”
“啊，抱歉，我本来是要在这里照顾你的来着，我去给你倒杯热水。”
与此同时，一辆刚恢复行驶方向的汽车，在经过简单的修补——用胶带固定住掉落部件后，再次缓缓启动。随着轮胎的转动，车身也跟着摇晃，似乎随时都有可能解体。
“不用担心，我最重要的任务就是保护好他。所以，请帮我准备好直达的运输车。”葛城美里在车载电话中吩咐道，并补充，“对，毕竟是我提议去接他的。我会负起责任的，先挂了。”挂断电话后，她心中暗想：“真是倒楣又麻烦，车子才刚修好，现在又变成这样了。贷款还有33期未还，修理费用也是一笔不小的开销，更别说我还特意打扮了一番来接他……为什么奥特曼不能早点出现，消灭那个使徒呢……那样的话，就不会有这么多麻烦事了……”
“美里小姐。”
“什么事？”
“这么做真的没问题吗？”碇真嗣看着葛城粗犷的修车手法，不禁问道。
“没关系，现在是特殊时期，为了发动车子，这是没办法的。再说，好歹我也是国际公务员，这点小事难不倒我的。”葛城轻松地回答。
“这理由听起来并不充分。”碇真嗣直言不讳。
“你这孩子，长得可爱，却这么严肃。”葛城调侃道。
“是这样吗？”碇真嗣反问。
“怎么，生气了？”葛城挑眉。
碇真嗣一脸幽怨地盯着葛城，后者顿时无语，连开车都变得左摇右摆。
另一边，NERV的副司令冬月耕造看着屏幕上正在自我修复的使徒，评论道：“如预期一般，它正在进行自我修复。”
“这才是它的本色，不然还有什么稀奇古怪的能力。”碇司令说罢，使徒便发射了一道激光，将其屏幕变成了雪花屏。
“真厉害，不仅能自动增强机能，似乎还具备一定的智能。看来它再次发起攻击只是时间问题。”冬月博士的话音刚落，屏幕恢复了正常，视角从俯视转为仰视。
“闸门即将关闭，请注意安全。启动。”
碇真嗣凝视着手中的资料，低声念道：“特务机关NERV。”
“没错，那是联合国直属的秘密组织。”葛城解释道。
“我爸爸就在那里吗？”
“没错，你知道你父亲的工作是什么吗？”
“老师说过，爸爸的工作是保护人类。”碇真嗣想了想回答。
“很好，现在我将本次作战的指挥权交给你，让我们看看你的能力。”联合国军将领A说道。
“了解。”
“碇，我们的武器对这目标无效，你真的能战胜它吗？”将领B质疑。
碇司令扶了扶眼镜，坚定地说：“NERV就是为了这一刻而存在。”
“我们拭目以待。”将领C说完，三人缓缓降落。
“目标行动模式不变，目前迎击系统只能运行5%的功能。”
“联合国军也束手无策了吗？你打算怎么办？”冬月向碇询问。
“启动初号机和零号机。”
“但其中一台没有驾驶员啊。”
“没关系，另一名候补驾驶员正赶往这里。”
“我们现在要去见爸爸吗？”碇真嗣问。
“是的。”葛城答道。
提到父亲，碇真嗣突然想起了过去的经历，幽幽地说：“爸爸……”
“对了，你爸爸有没有给你ID卡？”葛城突然问道。
“有的。”碇真嗣从书包中拿出一张卡片递给葛城。
“谢谢。”葛城接过卡片，“你看看这个。”说着，她递给了碇真嗣一本文件。
“爸爸的工作……是要我做什么吗？”碇真嗣接过文件，若有所思。
“如果没事，爸爸怎么会写信给你呢？”葛城轻声说道。
“是啊，我们的关系确实不太好。”碇真嗣叹气。
“和我一样。”葛城附和。
两人乘坐的运输车疾驰在第三东京市的地底道路上，周围只剩下低矮的建筑。葛城解释道：“因为巴尔坦星人的缘故，这里没有高楼。”
“哇，好棒！这就是第三新东京市吗？真的好壮观，是个地下城市啊。”碇真嗣惊叹。
“没错，这是我们的秘密基地，NERV总部。虽然现在的规模比以前小了很多，但这里依然是人类的堡垒。”葛城介绍道。
不久后，他们抵达了NERV总部。葛城站在走廊上，试图找到正确的路线。
“应该是这条路。”葛城边走边说，风轻轻拂过她的裙摆。“因为这里是地下的关系，不太适合穿裙子。不过绿子到底在哪里呢？不好意思，我对这里还不太熟悉。”
“我们刚才已经走过这里了。”碇真嗣提醒道。
“不过没关系，机器就是为人类服务的嘛。”葛城乐观地说道。
“技术部一课，E计划负责人赤木律子博士，请尽快与作战部一课的葛城美里一尉联系。”广播响起。
刚从EVA池出来的赤木律子听到广播，忍不住吐槽：“真是服了他，又迷路了啊。”
又过了一段时间后，葛城美里和碇真嗣终于找到了一条看似正确的路，两人登上了电梯。电梯门打开的那一刻，葛城成功与赤木律子会合。
“律子。”
“你怎么搞的？葛城一尉，现在不仅人手不足，时间也非常紧迫。”赤木律子责备道。
“抱歉。”葛城美里试图用卖萌的方式蒙混过关。
“她就是那个男孩吧。”
“是的，根据马鲁杜克报告书选出的第四适格者。”葛城介绍。
“请多关照了。”碇真嗣礼貌地说道。
“是。”赤木律子应声。
“这孩子和他的父亲真像，一点都不可爱。”赤木律子打趣道。
此时的画面切换至碇司令那里。
“现在这里就交给你了。”碇司令说完这句话后，缓缓下降，准备迎接挑战。
“时隔三年的重逢啊。”他心中默念。
“副司令，目标再度开始移动了。”一位工作人员报告。
“全体人员准备进入第一阶段战斗。”副司令冬月耕造命令。
“全体人员准备进入第一阶段战斗，准备对地迎击战。”指令迅速传达下去，NERV内部一片紧张而有序的备战气氛。
